Five Nights at Freddy's: Security Breach presenta seis finales diferentes, cada uno con una escena animada (ya sea de estilo cómic o completamente en 3D) justo antes de los créditos y, a veces, una imagen de epílogo después de que finalicen los créditos. Su DLC, Ruin, presenta otros 3 finales.
Security Breach[]
Final Malo[]
Se logra simplemente terminando el juego y saliendo por la entrada principal.
La escena muestra a Gregory huyendo del Mega Pizzaplex solo para luego encontrarlo durmiendo en una caja de cartón en un callejón, cubriéndose con un periódico. La sombra de Vanny se puede ver cerca de él al final de la escena, lo que significa que finalmente atrapó al niño.
Final Bueno[]
Se logra al obtener una Insignia de Seguridad de nivel 7 y luego salir por el Muelle de Carga de la Cocina.
La escena muestra a Glamrock Freddy y Gregory alejándose en una camioneta conducida por este último. Freddy de repente se queda sin baterías, por lo que Gregory lo recarga con la batería de la camioneta y juntos siguen conduciendo hacia el amanecer.
La imagen posterior a los créditos muestra un artículo periodístico que informa que Freddy ha sido reemplazado por Montgomery Gator, siendo él mismo reemplazado por un nuevo animatrónico Glamrock; Glamrock Mr. Hippo.
Final Desenmascarado[]
Se logra saliendo por la salida de emergencia del Mostrador de Premios.
La escena muestra a Gregory corriendo hacia el techo del Pizzaplex mientras Freddy prende fuego a los animales de peluche en el mostrador. Una vez que Gregory llega al techo, es capturado por Vanny, quien es luego interceptada por Freddy. Durante el forcejeo, Freddy se arroja a sí mismo y a Vanny por la cornisa. Mientras Freddy se despide de Gregory durante la caída, Gregory desciende rápidamente a la calle, solo para encontrar a Glamrock Freddy ya destrozado y a Vanny muerta a su lado, cuya máscara Gregory quita para luego revelar cuán similar es a Vanessa, para gran confusión de Gregory.
La escena posterior a los créditos muestra a Vanessa aparentemente todavía viva iluminando la calle desde el techo con preocupación. Luego, un artículo periodístico informa que el Mega Pizzaplex fue incendiado y que los juguetes inflamables de este han sido retirados del mercado.
Final Desmontado[]
Se logra encontrando la guarida de Vanny y en la entrada de Pizzaplex, haciendo clic en la opción "Vanny", luego ingresando a la guarida de Vanny y finalmente presionando el botón.
La escena muestra a Vanny encontrando a Gregory en su guarida, y mientras ella se ríe y se acerca para agarrarlo, él presiona un botón y ordena a los S.T.A.F.F. Bots para "desmontar" a Vanny, comenzando su ataque brutal contra Vanny. Gregory luego se acerca a un gravemente dañado Freddy, quien le dice que él es su superestrella antes de apagarse.
La escena posterior a los créditos muestra un artículo de periodístico que informa que el Mega Pizzaplex se cerró debido a problemas de salud y planea reabrir la próxima temporada.
Final Salvador[]
Considerado el verdadero final, se logra al completar Princess Quest 1, 2 y 3.
La escena muestra la pantalla de Princess Quest 3 rompiéndose y Gregory saliendo de la guarida de Vanny. Afuera, ve que todos los S.T.A.F.F. Bots se han derrumbado en el suelo y la máscara y la pajarita de Vanny también están en el suelo y Vanny no se ve por ningún lado. Gregory luego regresa a la salida principal del Pizzaplex mientras lleva una bolsa de lona que contiene la cabeza de Freddy. Luego, ambos se acercan a Vanessa, que los espera en las puertas.
La escena posterior a los créditos muestra a Gregory, la cabeza de Freddy y Vanessa sentados en lo alto de una colina, disfrutando del amanecer mientras Gregory y Vanessa comen helado.
Final Afton[]
Blob atacando a Burntrap.
Para lograrlo, el jugador necesita obtener las actualizaciones de garra, ojos y caja de voz para Freddy, luego bajar por el viejo ascensor hasta el ahora quemado Freddy Fazbear's Pizza Place y derrotar a Burntrap.
La escena muestra a Gregory escapando junto a Glamrock Freddy de la pizzería en llamas mientras Burntrap intenta seguirlos, pero finalmente es capturado por The Blob. Tanto Gregory como Freddy logran escapar.
La escena posterior a los créditos muestra a Gregory y Freddy sentados en lo alto de una colina mirando el amanecer.
Ruin[]
Final Normal[]
Se logra escapando del animatrónico que imitaba y fingía ser Gregory, siguiendo las instrucciones del verdadero Gregory y llegar hasta el elevador con éxito.
La escena muestra al verdadero Gregory hablando con Cassie desde el megáfono del elevador y explicándole que al desactivar el sistema de seguridad M.X.E.S, dicho animatrónico esta libre, no pueden arriesgarse a que los siga, entonces Gregory se disculpa con Cassie y es cuando el elevador comienza a caer con ella dentro.
Durante los créditos, la voz de Roxy dice el nombre de Cassie, insinuando que puede estar viva.
Final Brasil[]
En lugar de correr hasta el elevador, hay que encontrar un recorte de Fredbear y ponernos la Máscara de seguridad.
La máscara nos muestra a Vanessa, Gregory y Helpy comiendo helado, sentados en lo alto de una colina y Gregory diciendo “¡Cassie! Estoy bien. Encontré un lugar para esconderme". Cassie respira de forma agitada, mientras empieza a sonar una canción alegre de fondo.
El nombre de este final hace referencia a una película de 1985 del mismo nombre, particularmente el final de dicha película.
Final Scooper[]
En los capítulos 1, 3, 5 y 7, habrán distintos sistemas de cámara, al hacer zoom en ellas veremos una especie de caja especial con líneas a través de ella. Hacer clic en esos desbloqueará una de las cuatro puertas que cierran la sala de recolección.
Cuando lleguemos a la parte de persecución con el animatrónico, ignoraremos las instrucciones de Gregory e iremos a la sala de recolección, ahí Cassie cierra la puerta antes de que el animatrónico la atrape, ella presiona un botón que activa una máquina parecida al Scooper que atrapa al animatrónico y presumiblemente matándolo en el proceso. Cassie aparentemente sobrevive ilesa, pero no está claro si logra escapar del Pizzaplex.